钟山石窟有着两棵神奇的树种，菩提和杜仲树。菩提树属于热带树种,生长在四季如春的西双版纳，杜仲树是一种药材树，树皮用来入药，主要在秦岭以南比较常见，北方的气候环境和地理位置是根本不可能生长出这两棵树来的，而这两种树却真真实实的生长在钟山石窟，实属罕见。就这两棵树而言，有人说是佛的法力无边，有人说是福地福气，有人说是天上的神鸟衔来树种落地生根，有的说暗寓普（菩提）渡（杜仲）众生之意，说明佛门圣地是上天所赐，天然雕饰。